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Entre los músicos, Morgenstein es ampliamente conocido por su trabajo con los Dixie Dregs, banda liderada por el guitarrista Steve Morse, formada en la década de los 70’s, Morgenstein y el resto de la banda eran estudiantes de la Universidad de Miami. Con prácticamente ningún apoyo de la radio, pero una gran reputación boca-a-boca, la banda obtuvo una gran fuerza. The Dregs recibió nominaciones al Grammy por cada uno de sus últimas seis grabaciones y cobertura tanto en revistas especializadas de música a lo largo de la década de 1980. La revista Modern Drummer nombró a Morgenstein Mejor Baterista de Rock Progresivo durante cinco años consecutivos. Rod también fue votado como el mejor baterista de All-Around en su lector de la encuesta de 1999.
Después de que Dregs se disolvió, Morgenstein continuó de gira y grabando con la banda de Steve Morse hasta 1986, cuando Morse tuvo un concierto con el grupo Kansas.
Rod sigue grabando y haciendo giras con Winger y The Dixie Dregs, así como su dúo con el teclista de Dream Theater El Rudess Morgenstein Project, Jazz Jam Band Is Dead y The Jelly Jam, un power trío con John Myung (bajo Dream Theater) y Ty Tabor (guitar-vox/King ‘s X).